Đề án 06 đã đạt được nhiều kết quả tích cực với 55 nhiệm vụ hoàn thành và 10 kết quả nổi bật. Tuy nhiên, vẫn còn 45 nhiệm vụ chậm tiến độ do các vấn đề về pháp lý, tạo lập, kết nối chia sẻ và làm sạch dữ liệu. Thứ trưởng Nguyễn Văn Long đề xuất Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo các bộ, ngành và địa phương tập trung thực hiện các nhiệm vụ trọng tâm.
Khu kinh tế Vân Phong, Khánh Hòa đang đối mặt khó khăn về giải phóng mặt bằng, làm chậm tiến độ nhiều dự án. Quy hoạch chuyên ngành chưa đồng bộ, chỉ tiêu sử dụng đất hạn chế cũng khiến nhà đầu tư e ngại. Dù vậy, khu kinh tế này vẫn có tiềm năng trở thành động lực phát triển của tỉnh và Nam Trung Bộ nhờ vị trí thuận lợi.